LEADER 04542nam 2200469z- 450 001 9910574875003321 005 20230221125247.0 024 7 $a10.35985/9789585522381 035 $a(CKB)5600000000470619 035 $a(oapen)https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 035 $a(EXLCZ)995600000000470619 100 $a20202206d2018 |y 0 101 0 $aspa 135 $aurmn|---annan 181 $2rdacontent 182 $2rdamedia 183 $2rdacarrier 200 10$aInteracciones intermoleculares de la proteína de membrana Arf*GTP con potasio y glicerol, componentes mayoritarios de la vinaza de caña de azúcar 210 $aColombia$cUniversidad Santiago de Cali$d2018 215 $a1 electronic resource (47-92 p.) 311 1 $a9585522381 311 0 $aPrint: 9789585522374 330 $aLa vinaza de caña de azúcar, al ser un residuo producido en altas cantidades derivado de los procesos industriales para la producción de Etanol, es una mezcla de compuestos que tiene una utilidad cíclica para matrices de suelos debido a su composición natural e industrial que recaen en las ventajas y desventajas de sus aplicaciones. El potasio y el glicerol, compuestos mayoritarios en su composición, son ligandos que ayudan a la conformación de complejos proteicos con la vinaza para tener alternativas en los usos industriales como aditivos para alimento animal y fertilizantes en matrices de suelos, muchos de estos, utilizados en cultivos de las mismas industrias. Estudios de química computacional permiten conocer propiedades intermoleculares entre la vinaza, el glicerol y el potasio mediante in-eracciones moleculares estables convirtiéndola en una herramienta útil de evaluación de dichas propiedades y determinación de nuevas alternativas para usos industriales de este residuo. En esta investigación, se evaluó la dinámica de las interacciones intermoleculares entre el modelo proteínico tridimensional extraído del archivo de la base de datos de proteínas (PDB) por sus siglas en inglés, del modelo (2KSQ), el cual consiste en una proteína de membrana de la Echoli llamado Arf*GTP, con dos ligandos como potasio y glicerol mediante dinámica molecular utilizando un software llamado Dinámica Molecular Escalable por sus siglas en inglés, NAMD1. Se observaron y evaluaron las interacciones intermoleculares por medio del soft-ware llamado Visor de Dinámica Molecular por sus siglas en inglés, VMD2 de la molécula modelada de la proteína de membrana Arf*GTP con componentes mayoritarios, tales como, el potasio y el glicerol en un ambiente solvatado definido e implícito de modelo de caja de agua (TIP3) con el fin de identificar y caracterizar las fuerzas intermoleculares, equilibrio en trayectorias, fluctuaciones atómicas, afinidades, constantes de velocidad e interacciones Arf*GTP-Potasio, Arf*GTP-Glicerol y Arf*GTP-Potasio-Glicerol en el contexto de usos industriales de la vinaza como alimento animal y fertilizantes. Final-mente, se observó que los tres complejos Arf*GTP se ven favorecidos por afinidades posicionales de los ligandos como los aminoácidos GLN 155, para el caso del potasio, y para los gliceroles lo fueron GLY 27 y LYS 127, como también, apantallamientos de algunos átomos de los aminoácidos con los ligandos. Con esta investigación, se busca tener más información acerca de las interacciones intermoleculares y constantes de velocidad, equilibrio de trayectorias y afinidades químicas de la proteína de membrana Arf*GTP con otros ligandos orgánicos e inorgánicos que aporten nuevas alternativas industriales para el uso de la vinaza de caña de azúcar. 606 $aPollution control$2bicssc 607 $aColombia$2fast 610 $aDinámica molecular 610 $aNAMD 610 $aVMD 610 $aBLAST 610 $aQuímica Computacional 610 $aCHARMM 615 7$aPollution control 676 $a628.16 700 $aRojas Álvarez$b Oscar Eduardo$4auth$01304104 702 $aBonilla Millán$b Fernando$4auth 702 $aRodríguez Estrada$b Jhon Alexander$4auth 702 $aRojas Álvarez$b Oscar Eduardo$4edt 702 $aRojas Álvarez$b Oscar Eduardo$4oth 906 $aBOOK 912 $a9910574875003321 996 $aGTP con potasio y glicerol, componentes mayoritarios de la vinaza de caña de azúcar$93027274 997 $aUNINA